根据2018年7月19日联盟发起人会议通过并于会后签署的《联盟发起人协议》，中国航天科技集团有限公司科学技术委员会等14个发起人单位成为联盟创始成员。2018年11月26日，经各发起人单位以通信方式审核，同意接收东北农业大学园艺园林学院等28个单位为第一批联盟成员。现将航天育种产业创新联盟成员单位（第一批，共42个）名单公布如下：

中国航天科技集团有限公司科学技术委员会

中国农业大学

中国热带农业科学院

中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所

中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

北京中医药大学

北京市农林科学院

国家植物航天育种工程技术研究中心

林木育种国家工程实验室

黑龙江省农业科学院园艺分院

中粮营养健康研究院

北京大北农科技集团股份有限公司

中国遥感应用智慧产业创新联盟

神舟绿鹏农业科技有限公司

东北农业大学园艺园林学院

云南省农业科学院花卉研究所

内蒙古自治区生物技术研究院

宁夏现代农业有限公司

北京北林先进生态环保技术研究院有限公司

陕西中科航天农业发展股份有限公司

天韬药业科技有限公司

北京市农业机械研究所有限公司

北京航天华阳环境工程有限公司

重庆璧山国家农业科技园区管理委员会

江苏省东海县农业委员会

航天科工空间工程发展有限公司

贵州航天智慧农业有限公司

海南航天投资管理有限公司

黑山县东方蔬菜种植专业合作社

龙口市茂源果蔬专业合作社

黄山四月乡村农艺场有限公司

山西恒穗航天育种研究中心

火星红农业科技（北京）有限公司

福建天辰航天育种科技有限公司

五洲丰农业科技有限公司

杭州富阳归园田居生态农业开发有限公司

北京诚智恒硕生态农业发展有限公司

金禾佳农（北京）生物技术有限公司

宁夏成功红黛墨酒庄管理服务有限公司

云南千景树种植园有限公司

北京市东城区青少年科技馆

中军文旅大数据科技有限公司

航天育种产业创新联盟

2018年12月2日